Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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DUX4L9Q6RFH8 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DUX4L9Q6RFH8 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DUX4L9Q6RFH8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DUX4L9Q6RFH8 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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