Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
AP5B1Q2VPB7 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms