Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CCDC142Q17RM4 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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