Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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