Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01024-206ENST00000522747 1044 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL357093.2-202ENST00000556942 498 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP000915.2-201ENST00000582120 454 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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