Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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