Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RFTN1Q14699 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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