Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
NEUROD1Q13562 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms