Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXI1Q12951 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXI1Q12951 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXI1Q12951 HOXB-AS1-203ENST00000504972 680 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXI1Q12951 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXI1Q12951 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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