Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXF1Q12946 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXF1Q12946 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXF1Q12946 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXF1Q12946 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXF1Q12946 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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FOXF1Q12946 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXF1Q12946 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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