Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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PTPRMP28827 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
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