Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms