Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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USP18Q9UMW8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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