Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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