Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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NDUFA9Q16795 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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