Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NTRK2Q16620 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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