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| BRD3 | Q15059 | AC018442.3-201 | ENST00000523025 | 183 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | GLYAT-203 | ENST00000529732 | 1070 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR9G2P-201 | ENST00000533326 | 880 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007068.2-201 | ENST00000543168 | 395 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009729.1-201 | ENST00000548873 | 1133 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC01189-201 | ENST00000428440 | 3321 nt | TSL 2 BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHST9-203 | ENST00000618847 | 11388 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL606537.1-201 | ENST00000607258 | 2011 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MARVELD2-204 | ENST00000454295 | 4376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | DDAH1-204 | ENST00000535924 | 3909 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | NCOR1-202 | ENST00000395848 | 3106 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02421-201 | ENST00000542219 | 3135 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | PLEKHA1-203 | ENST00000368990 | 14010 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | DYNC1I2-202 | ENST00000397119 | 2604 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINGO2-204 | ENST00000613945 | 2981 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | EFCAB5-201 | ENST00000394835 | 5132 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004014.2-201 | ENST00000623718 | 5122 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | CPA3-201 | ENST00000296046 | 1795 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | CYP51A1-204 | ENST00000450723 | 1729 nt | TSL 2 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | HDAC1P2-201 | ENST00000453661 | 1398 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | DPH5-203 | ENST00000370109 | 1316 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTRNR2L8-201 | ENST00000536684 | 1303 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007878.1-201 | ENST00000434786 | 1615 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAD1P1-201 | ENST00000231383 | 813 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | HIST1H1A-201 | ENST00000244573 | 648 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | FCER1G-201 | ENST00000289902 | 591 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | DAPL1-201 | ENST00000309950 | 552 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | ARGFX-201 | ENST00000334384 | 992 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | U3.10-201 | ENST00000364459 | 214 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092634.1-201 | ENST00000366505 | 199 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRBV6-7-201 | ENST00000390373 | 344 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | DAPL1-203 | ENST00000409042 | 544 nt | TSL 4 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006509.1-201 | ENST00000420788 | 634 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC016766.1-201 | ENST00000429636 | 714 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092106.2-201 | ENST00000436597 | 487 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AP000949.1-201 | ENST00000438328 | 629 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC01681-201 | ENST00000439184 | 760 nt | TSL 2 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRTOMT-209 | ENST00000440313 | 253 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC009567.2-201 | ENST00000502989 | 349 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093801.1-201 | ENST00000504017 | 307 nt | TSL 2 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02430-201 | ENST00000504755 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GNG2-203 | ENST00000553432 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL049779.3-201 | ENST00000557141 | 606 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MORF4L1-205 | ENST00000558502 | 855 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MDFIC2-201 | ENST00000567252 | 778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02520-201 | ENST00000570443 | 537 nt | TSL 4 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4675-201 | ENST00000577898 | 77 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090125.1-201 | ENST00000581541 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC011524.2-201 | ENST00000589198 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPS4XP21-201 | ENST00000603814 | 750 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00397-202 | ENST00000606785 | 409 nt | TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR6849-201 | ENST00000618543 | 69 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC244517.6-202 | ENST00000623884 | 566 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC061999.1-201 | ENST00000624454 | 177 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | RALGAPA2-201 | ENST00000202677 | 6152 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF766-201 | ENST00000439461 | 6298 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAB3GAP1-207 | ENST00000539493 | 3161 nt | TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010132.4-201 | ENST00000569883 | 1368 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | DSC3-201 | ENST00000360428 | 6939 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | IL21-AS1-201 | ENST00000417927 | 3748 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | FP236241.1-201 | ENST00000623374 | 7632 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | CU633967.1-211 | ENST00000624444 | 7628 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF566-202 | ENST00000424129 | 2644 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | OCM2-201 | ENST00000257627 | 696 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB4B-201 | ENST00000318157 | 332 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | RGS5-202 | ENST00000367903 | 934 nt | TSL 3 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | PLIN2-203 | ENST00000380465 | 631 nt | TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590635.1-201 | ENST00000406314 | 586 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | PTPN2P1-201 | ENST00000423212 | 1072 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022022.1-201 | ENST00000430304 | 178 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |