Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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BRD3Q15059 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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