Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SP140Q13342 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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