Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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FOXD4Q12950 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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FOXD4Q12950 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FOXD4Q12950 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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