Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms