Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms