Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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