Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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