Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNTN3Q9P232 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms