Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms