Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms