Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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