Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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FOXE3Q13461 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXE3Q13461 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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