Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ACTBP60709 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms