Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
EPHB4P54760 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms