Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC090358.1-201ENST00000579862 852 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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