Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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