Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
EHD3Q9NZN3 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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