Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAPPC6BQ86SZ2 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC6BQ86SZ2 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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