Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms