Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SYCP1Q15431 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms