Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms