Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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GAPVD1Q14C86 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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GAPVD1Q14C86 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
GAPVD1Q14C86 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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