Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CDH18Q13634 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CDH18Q13634 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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CDH18Q13634 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDH18Q13634 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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