Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTP4A2Q12974 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTP4A2Q12974 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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