Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms