Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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