Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
LRRTM2O43300 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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