Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TM6SF1Q9BZW5 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms