Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTF1AQ7RTS3 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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