Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC073648.1-201ENST00000508957 930 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL358334.1-201ENST00000557152 174 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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