Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
GAPVD1Q14C86 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms