Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms