Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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TCIRG1Q13488 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TCIRG1Q13488 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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