Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SP140Q13342 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SP140Q13342 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SP140Q13342 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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